6 Mejores Conversores Gratis De Pdb A Pdf para PC

Este artículo contiene una lista de los mejores conversores gratuitos de PDB a PDF software para Windows. Utilizando este software gratuito, puede convertir la estructura molecular almacenada en un archivo Protein Data Bank ( PDB ) a Portable Document Format ( PDF ). Básicamente, puede guardar la vista de una estructura molecular en un formato imprimible como PDF. Para ello, puede incluso personalizar la vista molecular configurando varios parámetros de visualización, como el estilo de vista (Wireframe, Backbone, Sticks, Spacefill, Balls & Stick, Ribbons, etc.), la combinación de colores, mostrar u ocultar etiquetas, la vista molecular (átomos, hidrógeno, etc.), etc. También puede rotar o ampliar la estructura molecular y luego convertir la vista a formato PDF.

Muchos de estos programas son de modelado molecular. Por lo tanto, puede modificar la estructura utilizando las herramientas de construcción de moléculas disponibles, como añadir átomos, añadir hidrógeno, añadir estructuras químicas, etc. Además, son bastante buenos en la visualización de moléculas, ya que proporcionan un buen conjunto de herramientas de visualización como rotar, zoom, modo de vista, mostrar etiquetas, mover, girar, etc. Además, muchos de ellos también muestran estadísticas relacionadas con el modelo molecular y proporcionan herramientas de cálculo y análisis.

Además de PDB, también puede convertir otros archivos moleculares a PDF en la mayoría de estos programas. Los formatos de entrada más comunes son MOL, MOL2, ENT, XYZ y CML. En cuanto a la salida, puede convertir PDB a varios formatos de imagen como PNG, BMP, JPG, PS, EPS, etc. Lee el artículo para saber más sobre estos programas.

Mi software gratuito favorito de conversión de PDB a PDF para Windows:

Avogadro es mi software favorito de conversión de PDB a PDF de esta lista, ya que es un software avanzado que también es bueno para la visualización y el modelado de moléculas. También está muy bien diseñado con algunas herramientas adicionales relacionadas con el modelado molecular.

Molekel es otro buen programa que puedes probar para convertir PDB a PDF.

También te pueden gustar algunos de los mejores programas gratuitos PDB Viewer Software , Molecular Modeling Software , y Chemistry Simulation Software para Windows.

Avogadro

Avogadro es uno de los programas de modelado molecular de código abierto más populares para Windows, Linux y Mac. También puede utilizarse para convertir PDB a PDF, ya que dispone de una función específica para ello. También puede utilizarlo para convertir PDB a otros formatos, como PNG, BMP, JPG, SVG, EPS, POV, VRML, etc.

Generalmente, este software se utiliza para la visualización, construcción y edición de moléculas. Para ello, contiene un conjunto de herramientas muy completo. Algunas de sus herramientas son la proyección en perspectiva u ortogonal, el modo de pantalla completa, añadir hidrógenos, insertar (fragmentos, ADN/ARN, SMILES y péptidos), Super Cell Builder, Nanotube Builder, cambiar H por metilo, editor cartesiano, etc.

Cómo convertir PDB a PDF en Avogadro:

• Utilizando su función de apertura, importe un archivo PDB a este software.
• Edite el modelo molecular con las herramientas disponibles, si es necesario.
• Ahora, vaya a su menú Archivo y haga clic en la opción Exportar > Gráficos vectoriales y seleccione PDF como formato de salida para guardar la vista molecular en formato PDF.

Antes de la conversión de PDB a PDF, puede personalizar los ajustes de visualización para exportar una vista personalizada de las moléculas a un archivo PDF o gráfico. Estos ajustes de visualización incluyen mostrar/ocultar ejes, fuerza, dipolo, polígono, anillo, stick, superficies, wireframe, etc.

Características adicionales:

• Contiene varias extensiones que mejoran aún más su funcionalidad como Optimizar Geometría, Calcular Energía, Búsqueda de Conformadores, GLSL Shaders, etc.
• Además de PDB, soporta varios formatos de archivos de entrada como CML, XYZ, MOL, MOL2, ENT, GAMOUT, etc.

Conclusión:

Es un gran software gratuito de código abierto para convertir PDB a PDF que proporciona una buena calidad de salida. También puede modificar el archivo PDB antes de iniciar la conversión a PDF o a cualquier formato gráfico.

Página de inicio | Página de descarga

Molekel

Molekel es un software gratuito de visualización de archivos de moléculas que también puede utilizarse para convertir PDB a PDF. Ofrece una opción directa para convertir archivos PDB a formato PDF. Así, puede importar fácilmente un archivo de estructura PDB y luego guardarlo en un archivo PDF. Además, puede convertir otros archivos moleculares a PDF, ya que admite un gran número de formatos de entrada, como XYZ, YOB, ALC, SDF, SMI, RXN, PCM, PQS, MOL, MOL2, TMOL, etc.

Cómo convertir archivos PDB a PDF.

Cómo convertir PDB a PDF en Molekel:

• Sólo tiene que abrir un archivo PDB en Molekel y visualizarlo y analizarlo con sus avanzadas herramientas de visualización.
• A continuación, en el menú Archivo, haga clic en la opción Guardar en PDF para convertir PDB a PDF.

Características adicionales:

• Puede personalizar varios ajustes de visualización antes de convertir la estructura PDB a PDF, como el fondo, la vista de la molécula (ball & stick, stick, wireframe, etc.), el átomo, el enlace, las propiedades de la vista 3D, etc.
• Le permite grabar animaciones moleculares y exportarlas.
• Ofrece algunas funciones de análisis, como sonda plana, distancia, ángulo, ángulo diedro y espectro de radiación.
• Puede convertir archivos PDB y otros archivos de estructura molecular en imágenes PS, EPS, PNG y TIFF.
• También puede ver propiedades básicas de modelos moleculares y estadísticas relacionadas con átomos, enlaces, energía, residuos, conformadores, masa molar, masa exacta, multiplicidad de espín, frecuencias de vibración, etc.

Conclusión:

Es un buen conversor de PDB a PDF que proporciona también algunas herramientas avanzadas de visualización molecular.

Página de inicio | Página de descarga

RasMol

RasMol es otro software gratuito de conversión de PDB a PDF para Windows. Es un bonito visor de archivos moleculares que también puede utilizar para convertir PDB u otro archivo de entrada compatible a varios otros formatos. Estos formatos incluyen BMP, GIF, IRIS RGB, PPM, Sun Raster, PostScript, POVRay, VRML, Raster3D, etc. Sin embargo, para convertir PDB a PDF, tendrás que utilizar su función Imprimir. Veamos los pasos necesarios para convertir una estructura molecular guardada en un archivo PDB a PDF.

&3

Cómo convertir PDB a PDF en RasMol:

• Importe un archivo PDB utilizando la opción Abrir.
• Después de eso, puede configurar la visualización de la estructura molecular utilizando las opciones disponibles, tales como el modo de vista (wireframe, backbone, sticks, ball & sticks, ribbons, strands, etc.), colores (monocromo, cadena, temperatura, habilitar o deshabilitar opciones como modos slab, hidrógenos, hetero átomos, etiquetas, estéreo, etc., y mucho más.
• Ahora puede utilizar su función print para convertir la vista personalizada de la estructura molecular PDB a formato PDF.

Conclusión:

Es otro buen software conversor de PDB a PDF, ya que también puede convertir PDB a varios otros formatos gráficos como se mencionó anteriormente. Además, soporta muchos otros formatos de archivo como entrada aparte de PDB, como Alchemy File Format, Sybyl MOL2 Format, MDL Mol File Format, CIF File Format, MOPAC File Format, etc.

Página de inicio | Página de descarga

ArgusLab

ArgusLab es un software gratuito de construcción molecular que puede utilizar para convertir PDB a PDF. Con él, podrá importar y visualizar fácilmente archivos de datos moleculares como PDB, XYZ, MOL, MOL2, etc., así como
como convertir estos archivos a otros formatos, incluidos PDF, TIFF, BMP, JPG y POV. Como le permite construir modelos moleculares, también puede editar un archivo PDB antes de la conversión.

Cómo convertir PDB a PDF utilizando ArgusLab:

• En primer lugar, abra un archivo PDB en él, que podrá ver en su interfaz.
• Ahora, si es necesario, puede modificar el modelo molecular utilizando herramientas como el modo de traducción, añadir átomos, añadir hidrógenos, eliminar hidrógenos, crear y editar superficies, etc.
• A continuación, para guardar la vista del modelo PDB en formato PDF, haga clic en su menú Archivo > opción Imprimir y seleccione "Microsoft Print to PDF" como impresora. De esta forma, podrá convertir PDF a PDF.

Características adicionales:

• Le permite explorar diferentes elementos de un PDB o de cualquier otro archivo molecular como Átomos, Residuos, Grupos, etc.
• Le permite realizar varios cálculos relacionados con el modelo molecular, como la energía, optimizar la geometría, Gaussian, etc.

Conclusión:

Es un software de construcción de moléculas con muchas funciones que también actúa como convertidor de PDB a PDF.

Página de inicio | Página de descarga

Jmol

Jmol es otro software gratuito de código abierto de conversión de PDB a PDF para Windows. Es un buen modelador de moléculas con el que puedes ver, editar y construir archivos moleculares. Además de PDB, funciona con otros formatos como MOL, MOL2, XYZ, CML, ENT y muchos otros formatos inusuales de archivos moleculares.

Cómo convertir PDB a PDF utilizando este modelador molecular gratuito de código abierto:

• En primer lugar, vaya al menú Archivo y utilice la opción Abrir para importar un archivo PDB.
• Ahora, puede editar la estructura molecular utilizando las herramientas de modelado disponibles.
• Después, utilice su función Imprimir para convertir PDB a formato PDF. Al hacerlo, asegúrese de que ha configurado la impresora como Microsoft Print to PDF.

Características adicionales:

• Contiene algunas herramientas adicionales que puede utilizar según sus necesidades, como Animate, Measurements, Vibrate, Surface Tool, Create Gaussian Input File, etc.

Conclusión:

Es un buen conversor portátil de PDB a PDF que no requiere instalación. Puede utilizarlo directamente sobre la marcha desde cualquier dispositivo de almacenamiento portátil.

Página de inicio | Página de descarga

BALLView

BALLView es otro conversor gratuito de PDB a PDF de código abierto de esta lista. Al igual que otros programas de la lista, también permite importar un archivo PDB e imprimir la vista de la estructura molecular en formato PDF. Aparte de PDF, también puedes utilizarlo para convertir PDB a otros formatos como PNG, POV, XHTML, VRML y STL.

Además de PDB, soporta otros formatos de archivos químicos que puedes ver, editar o convertir. Estos formatos de entrada incluyen MOL, MOL2, XYZ, ENT, AC, SD, etc.

Cómo convertir PDB a PDF utilizando BALLView:

• El primer paso es importar un archivo PDB utilizando su opción Archivo > Abrir > Estructura.
• A continuación, utilice su opción Imprimir y seleccione Microsoft Print to PDF como impresora para convertir PDB a PDF.

Conclusión:

Es otra alternativa decente para convertir un archivo de Banco de Datos de Proteínas a formato PDF.

Página de inicio | Página de descarga