5 Mejores Programas Gratuitos De Flujo para PC

He aquí una lista de Los mejores programas gratuitos de citometría de flujo para Windows. Estos programas gratuitos se utilizan para analizar datos de citometría de flujo almacenados en archivos Flow Cytometry Standard ( FCS ). Algunos también admiten archivos TXT. Proporcionan diferentes tipos de gráficos para visualizar, interpretar y analizar datos de experimentos de citometría de flujo. Estos tipos de gráficos incluyen Dot Plot, Density Plot, Intensity Plot, Histograma, Overlay Histogram, Cumulative Distribution, etc. gráficos. También puede ver estadísticas totales como eventos, media X/Y, geomean, mediana, etc. Una de ellas proporciona un amplio número de herramientas de análisis estadístico, entre las que se incluyen Calculadora Estadística, Calcular Relación de Dos Parámetros, Calculadora de Celdas Avanzada, etc.

Para analizar gráficos de forma elaborada, estos programas también proporcionan herramientas como crear región, marcador, cuadrantes, zoom, panorámica, etc. Estas herramientas le permiten guardar datos estadísticos en un archivo TXT. Incluso puede exportar el gráfico a una imagen como PNG, BMP, etc.

Mi software gratuito favorito de citometría de flujo para Windows:

Flowing Software es mi software favorito de citometría de flujo para Windows. Proporciona un buen número de herramientas para analizar archivos FCS. Además, su interfaz de usuario es bastante sencilla e intuitiva.

También te pueden gustar PID Simulator Software , Data Visualization Tools , y Statistical Analysis Software para Windows.

Flowing Software

Flowing Software es un software de citometría de flujo sencillo y fácil de usar para Windows. Viene con varias herramientas para analizar datos de experimentos de citometría de flujo. Le permite realizar análisis de citometría de flujo en datos almacenados en archivos FCS y TXT (delimitados por tabuladores). Proporciona una amplia gama de herramientas en diferentes categorías que son las siguientes:

  • Herramientas de visualización : Esta categoría contiene las principales funciones de análisis gráfico, como Diagrama de puntos, Diagrama de densidad, Diagrama de intensidad, Histograma, e Histograma de superposición .
  • Herramientas de metadatos : Aquí encontrará Visor de metadatos, Matriz de compensación, Visor de datos de parámetros, y Visor de palabras clave .
  • Herramientas de Cálculo : Desde aquí se puede acceder a Calculadora de Estadísticas, Calcular Relación de Dos Parámetros, Calculadora Avanzada de Celdas y Herramientas de Fichas.
  • Herramientas de Modificación de Parámetros : Desde aquí se pueden cambiar los nombres de los parámetros, cambiar la visualización lin/log y crear ejes de tiempo.
  • Herramientas de modificación de datos : Aquí encontrará las funciones Ganancia virtual y Compensar datos .
  • Herramientas de recopilación : Esta categoría le ofrece herramientas como Recopilador de imágenes, Lista de recopiladores, etc.
  • Otras Herramientas : Algunas herramientas adicionales como Text Box, Tool Group, Region Control Tools, Automation Tools (Folder Runner, Update Counter, etc.), etc. también están disponibles en este software de flujo.

Cómo realizar análisis de citometría de flujo utilizando Flowing Software

  • En primer lugar, desde el menú File, abra New Analysis. Ahora, en el menú Crear, seleccione una herramienta para el análisis de citometría de flujo. Ahora puede abrir un archivo FCS o TXT que contenga experimentos de citometría de flujo y analizar sus datos relacionados. Le permite seleccionar múltiples herramientas una por una y abrir los análisis relacionados en la interfaz principal.
  • Puede crear estadísticas (eventos, media, geomean, media, etc.), crear regiones, copiar datos al portapapeles exportar datos a un archivo TXT, etc.
  • Puede guardar todo el análisis en su formato nativo para su uso posterior.

En definitiva, este es un gran software de flujo a utilizar para llevar a cabo análisis de citometría de flujo. Es bastante fácil de usar, pero en caso de que encuentre alguna dificultad, puede consultar este video tutorial .

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FlowPy

FlowPy es el siguiente software de flujo gratuito para Windows de esta lista. Puede abrir un archivo FCS o un archivo de Texto y luego elegir un tipo de gráfico para el análisis de citometría de flujo. Proporciona Histograma , Dotplot , y Distribución Acumulativa gráficos para visualizar los datos de citometría de flujo. Puede elegir un parámetro para trazar el gráfico respectivo, como FSC-A, FSC-H, FSC-W, SSC-A, SSC-H, SSC-W, Tiempo, etc. Consulte este enlace para conocer estos parámetros.

Algunas características de este software de citometría de flujo a tener en cuenta:

  • Le permite extraer datos estadísticos completos o datos parciales a un archivo de Texto.
  • Puede abrir diferentes tipos de gráficos en diferentes pestañas en este software.
  • En una pestaña de gráfico, obtiene herramientas como pan, zoom, subgráficos, línea, pegar puertas, etc.
  • Proporciona Clustering característica para hacer clusters seleccionando múltiples parámetros. Proporciona herramientas de análisis de datos como Histograma de sustracción y Estadística (Estadística total y Estadística de puerta).

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Cyflogic

Cyflogic es otro software de flujo libre para analizar datos de citometría de flujo. Proporciona Dot Plot, Histogram, Histogram Modeller, Overlay Histogram, 3D Plot, y ClipBook herramientas estadísticas para visualizar archivos FCS. Este software incluye muchas funciones que le permiten realizar análisis de citometría de flujo. Estas incluyen las siguientes opciones:

  • Puede abrir y ver estadísticas incluyendo número, media X, media Y, % de visibles, X geomean, e Y geomean.
  • Le permite personalizar el trazado usando opciones como Mostrar/Ocultar Cuadrante, Mostrar/Ocultar Líneas de Región, Invertir Color de Fondo, Activar/Desactivar Multicoloración, Cambiar Color de Trazado, Mostrar/Ocultar Líneas de Marcador, Establecer Suavizado, etc.
  • Puede establecer el límite de trazado rápido y el número máximo de eventos.
  • Puede copiar o incluso guardar datos de trazado como archivo TXT. También puede exportar el diagrama como imagen BMP. Además, puede guardar la vista del análisis para su uso posterior.
  • Algunas herramientas adicionales que ofrece este software son Impresión por lotes, Rotación de 360 grados, Navegador de archivos, Navegador de placas de pocillos, etc.

Nota: Es gratuito sólo para uso no comercial y académico.

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FCSalyzer

FCSalyzer es otro de los programas de flujo de esta lista. También le permite abrir y analizar documentos FCS. Veamos los pasos para hacerlo.

Cómo analizar datos de citometría de flujo usando este software gratuito

Primero, necesita seleccionar un tipo de gráfico desde su interfaz. Le permite analizar los datos de citometría de flujo en forma de Dot Plot,
Histograma y Diagrama de densidad. Ahora, seleccione un archivo FCS para trazar el diagrama respectivo. Así de sencillo. Puede utilizar sus herramientas como Cuadrante, Marcador, Ajustar Regiones y Puertas, Área de Texto, etc. para analizar el diagrama. También muestra datos sin procesar, estadísticas, etc. También puede exportar estadísticas a un archivo de texto, guardar el gráfico como imagen PNG, exportar eventos del gráfico a un archivo CSV, etc. Le permite guardar el documento de análisis en su formato de archivo nativo para poder abrirlo más tarde.

En general, es un software de flujo agradable y portátil, por lo que puede llevarlo en un dispositivo de almacenamiento portátil y utilizarlo sobre la marcha.

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Cellular Symphony

Cellular Symphony es otro tipo de software de flujo de esta lista. Es básicamente una representación musical de datos de citometría de flujo donde las células se denotan por notas musicales. Simplemente arrastre los archivos FCS a su sección de archivos, elija uno de ellos y luego seleccione Pitch parameters. Los parámetros de tono incluyen FSC-A, FSC-W, FSC-H, SSC-A, SSC-H, SSC-W, Time, IL2 PE, Dump, etc. Puede saber más sobre estos parámetros aquí . Ahora, seleccione los instrumentos respectivos para hacer sonar cada uno. También puede seleccionar el volumen de la nota, la duración de la nota de cada celda y el número total de celdas a sonar. Después de eso, pulse el botón de reproducción y se mostrará el gráfico de puntos como se puede ver en la captura de pantalla anterior. Puede ajustar el tamaño de los puntos y activar o desactivar la cuadrícula.

También proporciona una opción de grabación para grabar un archivo MIDI del sonido generado. Sin embargo, esta función no me funcionó bien durante las pruebas.

Este es también un software de citometría de flujo portátil que no necesita instalación y puede ser utilizado sobre la marcha.

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