4 Mejores Servicios Gratuitos De Creación De Árboles Filogenéticos En Línea

Aquí hay una lista de los mejores servicios gratuitos de creación de árboles filogenéticos en línea Un árbol filogenético es un tipo de árbol que destaca las relaciones evolutivas entre varias especies. También destaca la divergencia de una especie con respecto a otra. Si desea crear árboles filogenéticos utilizando varios datos de secuencias genéticas y del genoma, puede utilizar estos servicios de creación de árboles filogenéticos en línea. Todos estos servicios son de uso gratuito y se puede acceder a ellos desde cualquier lugar.

En estos servicios, los usuarios pueden introducir los datos del genoma de las especies en forma de formatos de archivo Newick, Nexus, FASTA, EMBL, etc. Los usuarios también pueden pegar los datos del genoma de las especies directamente en estos servicios para generar un árbol filogenético. En el árbol generado los usuarios pueden ver las aristas, los nodos, los nombres de las especies, etc. Algunos servicios también utilizan códigos de color para diferenciar los distintos elementos de un árbol. A través de algunos servicios, los usuarios también pueden generar varios tipos de árboles como Circular, Rectangular, Sin raíces, etc. Además, los usuarios también disponen de herramientas para visualizar, analizar, y anotar un árbol filogenético. El proceso para generar un árbol filogenético también es bastante sencillo en todos estos servicios.

Después de ver y analizar un árbol filogenético, los usuarios pueden guardarlo o exportarlo en los formatos de archivo PDF, SVG, EPS, TXT, etc. Consulte la lista para saber más sobre estos servicios.

Mi servicio favorito de creación de árboles filogenéticos:

phyloT es mi servicio favorito porque puede generar un árbol filogenético utilizando varios tipos de datos del genoma y archivos de datos del genoma. Además, también permite a los usuarios anotar el árbol filogenético generado.

También puede consultar las listas de los mejores servicios gratuitos de Project Charter Tool , Cloud Productivity , y Portfolio Management .

phyloT

phyloT es un servicio gratuito de creación de árboles filogenéticos en línea Este servicio se basa en la taxonomía del NCBI o en la base de datos de taxonomía del genoma. Utilizando este servicio, los usuarios pueden generar y analizar fácilmente árboles filogenéticos utilizando datos taxonómicos presentes en archivos Newick, Nexus, o phyloXML . Antes de generar un árbol filogenético, los usuarios también pueden especificar Tipo de identificador de nodo (Nombres científicos, IDS de la taxonomía NCBI, etc.), Nodos internos (Colapsados o expandidos), Interrumpir en (Especie, Clase, Orden, Sin interrupción, etc.), y más. Después de especificar todos los parámetros, los usuarios pueden generar un árbol filogenético. A continuación, consulte las principales características de este servicio en línea.

Características principales:

• Modos de árbol : Este servicio en línea puede generar tres tipos de árboles filogenéticos, a saber, Circular, Rectangular, y Sin raíz .
• Anotaciones manuales : También cuenta con un buen conjunto de herramientas de anotación para anotar manualmente el árbol y editar la información existente.
• Herramientas de ajuste del árbol : Después de generar un árbol filogenético, el usuario puede ampliarlo, girar el árbol, cambiar la etiqueta, cambiar el estilo de la fuente del nombre de la especie, ajustar los rangos de color, etc.
• Herramientas Avanzadas : A través de ellas, los usuarios pueden activar o desactivar Visualización de Metadatos de Rama, Opciones de Nodo, y Punto Medio del Árbol Raíz .
• Exportar : Se utiliza para exportar el árbol filogenético generado SVG, EPS, PDF, PNG, y Texto (Árbol Newick, archivo PhyloXML, etc. ).

Reflexión final:

Se trata de un servicio de creación de árboles filogenéticos en línea con muchas funciones, a través del cual los usuarios pueden generar, analizar y anotar fácilmente árboles filogenéticos.

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phylogeny

phylogeny es otro servicio gratuito de creación de árboles filogenéticos en línea. A través de este servicio en línea, los usuarios pueden generar detallados
representación de árboles filogenéticos. Para generar un árbol filogenético, los usuarios deben introducir un conjunto de datos de secuencias en formato FASTA, EMBL o NEXUS. Los usuarios también pueden introducir o pegar un conjunto de datos de secuencias con formato en el campo de datos de este servicio. Después de introducir los datos o el archivo, los usuarios tienen que hacer clic en el botón Submit para generar y ver un árbol filogenético. A continuación, consulte las principales características de este servicio en línea.

Principales características:

• Resumen : Muestra un diagrama que destaca el proceso para generar un árbol filogenético. El proceso contiene la entrada del usuario, la alineación, la curación, la filogenia y la representación del árbol.
• Alineación : Utiliza la puntuación BLOSUM62 para resaltar la secuencia de datos en varios colores.
• Curación : Muestra varios resultados de la curación como el número de secuencias, la alineación asumida, el nuevo número de posiciones, los bloques de alineación, las posiciones de los flancos, y más.
• Filogenia : Muestra el diagrama del árbol filogenético sin el renderizado.
• Renderizado del árbol : Muestra un diagrama del árbol filogenético renderizado con aristas y nodos de la secuencia.
• Acciones : Este servicio también permite a los usuarios realizar varios cambios en un árbol filogenético renderizado utilizando acciones como el enraizamiento en el punto medio, el colapso de ramas, el intercambio, el giro, etc.
• Estilo de árbol : Después de renderizar un árbol filogenético, los usuarios pueden cambiar su estilo como Filograma, Cladograma, Radial, y Circular .
• Descarga del árbol : Se utiliza para descargar el árbol filogenético final en formatos de archivo PNG, PDF, SVG, TGF, Newick, y TXT .

Reflexiones finales:

Es otro buen servicio de creación de árboles filogenéticos en línea a través del cual los usuarios pueden generar árboles filogenéticos detallados y renderizados de varios tipos.

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ETEToolkit

ETEToolkit es otro servicio gratuito de creación de árboles filogenéticos en línea. Este servicio puede generar un árbol filogenético utilizando archivos o datos de Newick y Fasta . También viene con datos de ejemplo incorporados a través de los cuales los usuarios pueden generar un árbol filogenético de prueba. Ahora, echa un vistazo a las principales características de este servicio de creación de árboles filogenéticos.

Características principales:

• Ver árbol : Después de introducir los datos de la secuencia o el archivo a este servicio, pulse el botón Ver árbol para iniciar la generación del árbol filogenético.
• Árbol codificado por colores : El árbol filogenético generado por este servicio resalta diferentes nodos y elementos del árbol en colores únicos.
• Tipo de imagen de alineación : Utilizándolo, los usuarios pueden generar árboles filogenéticos en formato de bloques alineados, formato condensado y sin formato de alineación.
• Share : Este servicio genera un enlace permanente de un árbol filogenético que los usuarios pueden compartir con otros.

Características adicionales:

• Este servicio también ofrece algunas herramientas adicionales como Phylogenetic Tools Index, Phylogenetic Tools Cookbook, Python API reference, etc.

Reflexiones finales:

Es otro buen servicio de creación de árboles filogenéticos en línea a través del cual los usuarios pueden crear y analizar rápidamente el árbol filogenético utilizando datos en formato Newick y Fasta.

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Creately.com

Creately.com es otro servicio gratuito de creación de árboles filogenéticos en línea. Es un servicio estándar de creación de gráficos y diagramas que también puede utilizarse para crear árboles filogenéticos simples. A diferencia de la mayoría de los otros
servicios similares, no puede crear un árbol filogenético utilizando un genoma y una secuencia de datos. Para generar un árbol filogenético a través de este servicio, los usuarios tienen que utilizar manualmente elementos de diagrama estándar como formas, líneas de conexión, bloques de gráficos, etc., para hacer un árbol filogenético. A continuación, consulte las principales características de este servicio en línea.

Características principales:

• Formas : Esta sección contiene todas las formas y elementos de conexión para hacer un árbol filogenético o cualquier otro tipo de árbol con facilidad. Algunos de los elementos de forma que ofrece son el rectángulo redondeado, el círculo, el triángulo, el triángulo rectángulo, el octógono, el cono, el cubo y la línea, entre otros. Además de las formas, también ofrece herramientas de texto para dar nombres a los nodos y aristas de un árbol filogenético.
• Plantillas : Este servicio viene con plantillas para varios tipos de diagramas como Diagrama de Red, Diagrama GCP, Diagrama de Gantt, Mapa Conceptual, etc. Los usuarios también pueden utilizar y modificar las plantillas disponibles para convertirlas en un árbol filogenético.
• Exportación : Se utiliza para exportar el árbol final en formatos de archivo PNG, SVG, JPEG, y PDF .

Limitación:

• La versión gratuita de este servicio en línea ofrece formas básicas, documentos limitados y herramientas de colaboración limitadas. Además, no es un creador de árboles filogenéticos nativo.

Reflexiones finales:

Es un servicio decente de creación de árboles filogenéticos en línea a través del cual los usuarios pueden crear árboles filogenéticos y varios tipos de diagramas.

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